Впервые исследовано генетическое наследие древних людей – неандертальцев и денисовцев – в смешанных популяциях Центральной и Южной Америки. Оказалось, что количество древних аллелей в геномах этих популяций тем выше, чем выше доля америндского компонента в геноме. Отрицательная корреляция отмечается с долей африканского компонента. В сегментах генома америндского происхождения количество денисовских аллелей несколько выше, чем в сегментах европейского происхождения, что согласуется с популяционной историей коренного населения Америки. Найдены также кандидатные гены с архаичными аллелями, которые, вероятно, служили мишенями для отбора в американских популяциях.

Исследование древних геномов из Мезоамерики (полуостров Юкатан) продемонстрировало, что в регион проживания современных индейцев майя было несколько миграций. Помимо ранней волны колонизации Америки, с севера на юг, происходила миграция в противоположном направлении. Она привела из Южной Америки предков носителей чибчанских языков; последние внесли вклад в формирование генофонда майя и, возможно, именно они принесли с собой навык выращивания кукурузы.

В журнале PaleoAmerica опубликован анализ гипотезы заселения Америки с территории современной северной Японии (о. Хоккайдо), выдвинутой в 2019 г. На основании данных по антропологии и ДНК древнейших обитателей и современного населения Азии, Америки и Океании авторы пришли к выводу о том, что Японские острова не могли быть источником заселения Америки.

Геномное исследование популяций Южной Америки показало, что австралазийский компонент, ранее найденный у амазонских индейцев, распространен в разных географических регионах и в разных языковых группах южноамериканского коренного населения. В том числе его обнаружили на тихоокеанском побережье. Авторы считают, что этот компонент был получен по прибрежному миграционному пути еще до разделения тихоокеанской и амазонской ветвей, а затем распространился вглубь материка.

Палеогенетики вновь обратились к истории населения островов Карибского бассейна, изучив 174 древних генома из этого региона. Данные показали, что население древней эпохи Карибов было потомками одной миграции, около 6000 лет назад, а население керамической эпохи – потомками другой миграции, 2500-3000 лет назад. Источники обеих миграций – Южная и Центральная Америка, генетический вклад  Северной Америки не подтвердился. Большая доля родственников среди исследованных образцов указала на небольшой размер популяции. Авторы подсчитали, что к моменту прибытия европейцев население Карибов было гораздо менее многочисленным, чем считали ранее.

Проведено популяционно-генетическое исследование распределения африканского генетического вклада в современное население  Северной и Южной Америки. Результаты сопоставляются с историческим и демографическими  факторами периода работорговли.

Проведено масштабное популяционно генетическое исследование населения Соединенных штатов Америки. Геномные данные 32 с половиной тысяч человек, участников проекта Genographic, использовали для выявления генетического разнообразия, происхождения и картирования разных популяций. По анализу гаплотипов выявлены генетически неоднородные кластеры в разных этнических группах.  Показано разнообразие населения испано/латинского происхождения, генетический барьер в пределах афроамериканского населения, высокий уровень гомозиготности в группах азиатского происхождения и географическое распределение американцев европейского происхождения из разных стран.

Анализ четырех черепов (от 13 до 8 тыс. лет назад), найденных в пещерной системе в Мексике, говорит о значительном антропологическом разнообразии раннего населения Америки. И оставляет открытым вопрос о причинах этого разнообразия.

Геномные данные индейцев тупинигуим и других групп бразильских индейцев указали на миграционные пути населения Америки доколумбовой эры и подтвердили, что тупинигуим являются последней выжившей ветвью народа тупи.

Реконструирована генетическая история популяций из 12 стран Северной, Центральной и Южной Америки по широкогеномным данным. Изучены особенности генетических потоков в Америку из различных регионов Европы и Африки за последнюю половину тысячелетия, определены количество и время событий смешения в разных популяциях, а также гендерные особенности некоторых генетических потоков. Рассматривается отражение в генетической истории известных исторических событий– от европейской колонизации Америки до миграций XIX-XX веков.

Статья, на днях опубликованная в журнале Nature (Flegontov et al. 2019), призвана поставить точку в многолетнем споре об истории народов Северной Америки: палеоэскимосов и народов языковой семьи на-дене.

Одновременно вышли две статьи от коллективов палеогенетиков Эске Виллерслева и Дэвида Райха (журналы Science и Cell) с данными по секвенированию в общей сложности 64 новых древних геномов из Северной и Южной Америки. Открыты не известные ранее миграционные пути, связывающие два американских континента, в том числе показано, что распространение людей — носителей культуры Кловис, не ограничивалось Северной Америкой, а продолжилось в Южную Америку. Генетическая история Америки предстает как результат нескольких миграционых потоков, разветвляющихся по разным регионам, с эпизодами смешения и замещения популяций.

Анализ генетического разнообразия населения Кубы выявил три континентальных компонента в его генофонде: европейский, африканский и америндский (американских индейцев). Два последних компонента больше выражены в восточных провинциях острова, причем они оказались связаны с полом: европейские корни в основном прослеживаются по мужской линии, африканские и индейские – по женской. Реконструкция генетической истории кубинцев примерно соответствует исторически зарегистрированным миграционным событиям.

Ученые сравнили близкородственные Y-хромосомные линии у американских индейцев и в сибирских популяциях. Это позволило им вычислить время расхождения тех и других,  уточнить время первого заселения Америки и проверить гипотезу «берингийской остановки».

Исследовав 92 образца древней мтДНК коренных американцев, генетики реконструировали основные этапы заселения Америки, уточнив пути основных миграций и их время. Они также пришли к выводу о драматическом влиянии европейской колонизации на генетическое разнообразие коренного населения Америки. Оно привело к тому, что древние митохондриальные гаплотипы не сохранились в современных популяциях.

Объединив данные истории, археологии, дендрохронологии и палеогеографии, авторы нового исследования уточнили динамику сокращения численности индейцев в отдельно взятой провинции на юго-западе Северной Америки. Они делают вывод, что депопуляция началась не с момента первых контактов с европейцами, а со времени начала миссионерской деятельности. А с другой стороны, связывают эти демографические изменения с экологией и климатом в пределах всего континента.

Две статьи, вышедшие почти одновременно в Nature и Science, посвящены генетической реконструкции заселения Америки методами анализа полных геномов. Их выводы схожи. В статье команды Давида Райха (Nature), помимо основной миграции из Сибири, давшей начало всем коренным популяциям Америки, обнаружен – пока загадочный — «австрало-меланезийский след» у некоторых популяций южноамериканских индейцев. В статье команды Эске Виллерслева (Science) обнаружен тот же след, хотя его источник мог включать, кроме Австрало-Меланезии, еще и Восточную Азию. Кроме того, в этом исследовании публикуется большой массив новых генетических данных по древним и современным геномам американских индейцев, обосновывается миграция в Америку только после максимума последнего оледенения около 23 тысяч лет назад, отрицаются длительная «инкубация в Берингии» и особая миграция предков на-дене, а отделение ветви южных америндов (индейцев) от северных датируется примерно в 13 тысяч лет назад. Эти одновременные исследования представляют собой значительный рывок вперед в изучении истории генофонда двойного Американского континента.

Анализ генома скандально известного «Кенневикского человека» не совпал с антропометрическим анализом. Генетики показали его родство с популяциями американских индейцев, а не с полинезийцами и айнами, как первоначально решили антропологи.

Проанализировав и сравнив геномы жителей Центральной и Северной Америки с геномами современного населения Европы и Африки, оксфордские ученые смогли прояснить некоторые темные моменты в истории заселения Нового Света. Статья об этом вышла в журнале Nature Communications через неделю после того, как в журнале Nature вышла очень похожая статья, содержащая сделанные на основе анализа генетической информации выводы об истории заселения Великобритании.