На данный момент протестированы потомки двух сыновей Джучи (казахские Тука-Тимуриды и потомки узбекских Шибанидов), а также потомки Монгольского Даян-хана.
Гиреи не тестировались.
К сожалению, сейчас есть потомки только двух сыновей Чингиз-хана, а это практически делает невозможным вопрос об установлении отцовства Джучи (проверка данной средневековой сплетни).

На данный момент что-то трудно сказать по Чингизидам, имеющим свои генеалогии, так как слишком мало генетически тестированных случаев. Надеюсь, как наберем большое количество тестированных, то напишем хорошую большую статью.

В то же время вышеупомянутый старкластер четко коррелирует с нирунскими родами, основатели которых были в той или иной степени родственниками Чингиз-хана.

В исследовании И.А. Захарова-Гезехуса, упомянутой Вами, не было объявлено, что был обнаружен «ген Чингисхана». Это было сделано ранее в научной статье Tatiana Zerjal «The Genetic Legacy of the Mongols» под руководством Chris Tyler Smith (в то время работавшего в Оксфорде) (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1180246/ ).

Перед исследователями изначально не стояла задача найти «ген Чингисхана». В то время активно шли исследования структуры генофонда. В их случайно был обнаружен гаплотип «стар-класстер» в галпогруппе С3*, что характерно для сильного эффекта основателя, преимущественно встречавшийся в населении Азии. Методом молекулярных часов исследователями был подсчитан возраст этого кластера (позднее неоднократно перепроверенный в других исследованиях), который был близок к периоду правления Чингисхана. Авторы только предположили, что кроме Чингисхана и его родственников по отцовской линии, никто не мог оставить такое количество потомков, которое генетически наблюдается в настоящий момент.

Однако авторы статьи исследовали лишь популяции за пределами границ современной России. В то время исследования структуры генофонда населения России проводились параллельно. Поэтому был накоплен большой массив данных по тюрко- и монголозхычных народам России. Илья Артемьевич Захаров-Гезехус с коллегами решили исследовать «стар-класстер» среди этого массива коллекций и данных. Кроме того, как указано в его книге, он предпринял поиски тех участников генетических исследований, у кого был определен «стар-кластер», для того чтобы уточнить их происхождение, а также занялся поиском потомков чингизидов (этому посвящается почти целая глава книги, где представляется генеалогия некоторых участников).

В дальнейшем под его руководством были продолжены исследования чингизидов среди казахов, в которых участвовал и я. Однако не все линии чингизидов совпадали с гаплотипом «стар-кластера». Причины могли быть разные, и мы уже о них неоднократно писали в статье и в комментариях на этом портале (http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=349, в комментариях http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=4776 ).

Поэтому Ваши обвинения в пренебрежении исторической генеалогией некорректны и неуместны.
 

Резюмируя, хочу подчеркнуть, что ни зарубежные, ни отечественные генетики никогда не пренебрегали историко-генеалогической составляющей. Но даже генеалог-профессионал не может быть полностью уверен в реальных и достоверных ныне живущих потомках Чингисхана, или же в других аналогичных случаях. Поэтому мы всегда и стремимся к совместной работе генетиков, этнологов, и генеалогов-профессионалов.